Điều khiến Detective Conan có thể theo dõi lâu dài là cách tác phẩm đan nhiều tuyến chuyện. Người mới thường nghe nói “tập nào cũng có vụ án” rồi tưởng câu chuyện đứng yên; thực tế, các vụ án độc lập tạo nhịp đọc hằng tuần, còn bí mật thân phận và Tổ chức Áo Đen tạo mạch dài hơn.
Thám tử lừng danh Conan có hàng nghìn tình tiết và rất nhiều phim điện ảnh, nhưng người mới chỉ cần nắm tiền đề cốt lõi: thám tử trung học Shinichi Kudo bị Tổ chức Áo Đen làm teo nhỏ, lấy tên Conan Edogawa và sống gần văn phòng thám tử Mori. Từ đó, câu chuyện có hai nhịp song song: giải các vụ án riêng và lần theo tổ chức đã gây ra biến cố ban đầu.